Análisis de la concordancia entre los resultados del panel molecular de neumonía BIOFIRE® FILMARRAY® y el cultivo bacteriano de muestras respiratorias procesadas en el laboratorio clínico del Hospital Dr. R. A. Calderón Guardia durante el periodo julio 2020 – julio 2021

Abstract

La neumonía es un cuadro clínico que ocurre con la invasión del tracto respiratorio inferior por uno o varios microorganismos, bacterianos o virales. Es una causa importante de mortalidad y morbilidad a nivel mundial, y ejerce una presión importante sobre el sistema hospitalario. Por lo tanto, un diagnóstico certero y rápido es clave para establecer un tratamiento adecuado en el paciente. De esta forma, se reducen el número de complicaciones, los días de estancia en el hospital y los costos para el sistema de salud. En los últimos años se han desarrollado herramientas de diagnóstico molecular para el diagnóstico etiológico de la neumonía. Una de ellas son los PCR múltiplex, como el panel molecular de neumonía BIOFIRE® FILMARRAY® que detecta simultáneamente 18 bacterias, 7 marcadores de resistencia y 9 virus que causan neumonía y otras infecciones del tracto respiratorio inferior. El uso de este panel ha incrementado en ciertos centros de salud, como el Hospital Dr. R. A. Calderón Guardia, particularmente por la pandemia causada por el virus SARS-CoV-2. Por lo tanto, ha surgido la necesidad de evaluar la concordancia de los resultados de este panel con los de otros métodos diagnósticos, como el cultivo bacteriano. Dentro de los principales resultados del estudio es el hallazgo de una concordancia moderada entre ambos métodos diagnósticos: cultivo bacteriano y panel molecular (coeficiente k de Cohen: 0.56, intervalo de confianza al 95%: 0.54-0.58). Por otra parte, es importante rescatar el alto valor predictivo negativo obtenido para el panel molecular de neumonía (99.9%, intervalo de confianza al 95%: 99.7%-100.0%). Con todos los resultados, se puede concluir que las herramientas moleculares no sustituyen al cultivo bacteriano en el diagnóstico de la neumonía, sino que son un complemento al mismo. Este trabajo es el primero de su naturaleza realizado en el Hospital Dr. R. A. Calderón Guardia y pretende mejorar el algoritmo de trabajo en el laboratorio. Así mismo, se busca mostrar al resto del personal hospitalario aspectos importantes a tomar en cuenta a la hora de interpretar los resultados del panel.